Nintendo đã bắt đầu áp dụng hệ thống chống cheat trên Splatoon 2 từ hồi version 3.1.0.. Việc này Nintendo không báo rộng rãi mà chỉ âm thầm tiến hành, cũng như không ban một cách ồ ạt (Chắc để thu thập thông tin và update lại game trước). Theo oatmealdome.me thì khi đã bị đánh dấu, thường người mod game, cheat game sẽ bị ban một ngày sau đó. Chỉ cần mở game có nội dung chỉnh sửa là đủ để bị đánh dấu.